近年来，科技产业处在学校党委、行政的正确领导下，以科技服务为主线，以校企合作为平台，根据教育部《关于积极发展规范管理高校科技产业的指导意见》（教技发[2005]2号），结合我校实际，充分发挥学校的人才、技术、资源、品牌等优势，通过外联内合，引进社会优质资本，强强合作，使学校的产业规模不断发展壮大，校资产经营有限公司的注册资本金由原来的230万元达到目前的3130万元，开创了校办产业工作的新局面。公司引入现代企业管理理念，进一步完善内部组织架构，健全企业管理制度，协同创新、稳步推进，先后代表学校对外合作成立了福建国医堂资产管理有限公司、福建中医大投资发展有限公司、福建中医药大学高新技术产业园有限公司、福建中医大医院投资管理有限公司等4个公司，为学校教学、科研、人才培养等提供平台；为支持相关学科的发展，校资产经营有限公司出资新办了“福州至善中医药科技开发有限公司”、“福州修园健康管理有限公司”两家学科型公司，分别依托学校的保健食品研发中心及证研究基地，为该学科的发展提供支撑。校资产经营有限公司还出资成立了“闽侯杏春堂医药有限公司”为在校学生创业就业提供平台。
校资产经营有限公司还强化对经营性资产的管理，把全校经营性资产划转到资产经营公司，加大对校办企业的扶持力度，提供校内市场，拓展校办企业的发展空间，做大做强校办企业，提高社会效益和经济效益，确保国有资产保值增值。通过努力，2014年学校产业各项收入将突破1000万元。