综合发展部：负责公司的综合行政管理、文秘后勤等工作以及为公司决策层、经营管理部门出谋划策，提供决策参考依据；负责对公司发展的重大问题进行调查研究，为公司提供决策咨询服务；负责公司人力资源的开发、使用和管理，配合公司落实党建工作内容，处理、协调系统内外的党务日常事宜。

    财务部：负责公司的财务核算，资金调度工作，定期进行公司财务分析和财务风险管理，对公司财务进行审核、监督；指导并配合下属全资子公司的财务工作。  

    资产运营部：管理学校托管的国有资产，确保其在经营（生产）活动中保值增值；协同校内有关部门，健全各种资产管理制度；负责国有资产对外投资项目的市场调研、研究和前期策划等。

    科技服务部：负责学校对外服务的技术开发、技术服务、技术咨询、技术转让等项目的管理。制定规范的经费管理制度，充分利用和发挥学校科技、人才、平台及校友等优势，整合学校各类科技资源，与社会（企业）需求紧密联系，为学校科技人员服务企业、科技成果转化、产学研合作等提供现代企业制度下的媒介和管理平台，为中医药产业及海西经济发展贡献力量。